南方科技大学机械与能源工程自建系以来，依托境内外知名高校联合培养研究生，同时积极推进学科建设，2019年申请并获批“力学”一级学科下自主增设“智能制造与机器人”二级学科。2021年申请并获批“机械”领域工程硕士学位授予权。2024年申请并获批“机械”专业型博士学位授权点。

      本系现有36位博士研究生导师，学科研究主要包含五个研究方向：智能制造、成形制造及3D打印、机器人及其自动化、精密加工技术、能源工程。自2016年开始与境外知名高校联合培养博士研究生，与哈工大联培招收硕士、博士研究生，并于2019年开始招收南科大自主培养研究生。现已培养硕士毕业生261人，博士毕业生120人。